Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm22673-201ENSMUST00000104415 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Vmn1r73-202ENSMUST00000226516 6155 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Hoxd10P28359 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Hoxd10P28359 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.2 ms