Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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