Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Cldn4O35054 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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