Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm24725-201ENSMUST00000158229 125 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm24459-201ENSMUST00000082730 86 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm24142-201ENSMUST00000101960 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ApobE9Q414 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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