Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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Ccdc171E9Q1U1 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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Ccdc171E9Q1U1 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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Ccdc171E9Q1U1 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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Ccdc171E9Q1U1 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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Ccdc171E9Q1U1 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
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Ccdc171E9Q1U1 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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Ccdc171E9Q1U1 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
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Ccdc171E9Q1U1 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.2 ms