Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Chmp3Q9CQ10 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Chmp3Q9CQ10 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms