Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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Pggt1bQ8BUY9 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Pggt1bQ8BUY9 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Pggt1bQ8BUY9 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Pggt1bQ8BUY9 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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Pggt1bQ8BUY9 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Pggt1bQ8BUY9 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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