Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
Ccdc18Q640L5 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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Ccdc18Q640L5 Gm23711-201ENSMUST00000083856 83 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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Ccdc18Q640L5 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
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Ccdc18Q640L5 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc18Q640L5 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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