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| Foxd1 | Q61345 | Mir26a-1-201 | ENSMUST00000083579 | 90 nt | BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.79 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr1039-202 | ENSMUST00000214364 | 3925 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.79 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm44150-201 | ENSMUST00000203317 | 2619 nt | BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Dst-201 | ENSMUST00000097785 | 23251 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Zfp97-201 | ENSMUST00000147630 | 2684 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm23472-201 | ENSMUST00000101806 | 191 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Mir291a-201 | ENSMUST00000104815 | 82 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Olfr1039-203 | ENSMUST00000216566 | 4166 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Gm42482-201 | ENSMUST00000198904 | 1947 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr1325-202 | ENSMUST00000216007 | 3617 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Igkv6-13-201 | ENSMUST00000103395 | 287 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Zfp984-201 | ENSMUST00000105734 | 2729 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Vmn1r83-202 | ENSMUST00000226701 | 2788 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr1168-202 | ENSMUST00000215996 | 2322 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | 4930598N05Rik-207 | ENSMUST00000208997 | 83 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | AC157476.1-201 | ENSMUST00000215555 | 169 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Tug1-201 | ENSMUST00000132077 | 6719 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Vmn1r49-203 | ENSMUST00000226368 | 6276 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr657-203 | ENSMUST00000215454 | 2397 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Rps15a-ps5-201 | ENSMUST00000132586 | 393 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Gm23370-202 | ENSMUST00000197008 | 129 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | AC171203.1-201 | ENSMUST00000215363 | 456 nt | TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Mir137-201 | ENSMUST00000083635 | 73 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr857-203 | ENSMUST00000217450 | 2271 nt | TSL 3 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | AC153526.2-201 | ENSMUST00000218206 | 2031 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Tbx22-201 | ENSMUST00000068451 | 2947 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Syne1-205 | ENSMUST00000215295 | 27908 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Igkv17-127-201 | ENSMUST00000103309 | 341 nt | APPRIS ALT2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Tcrg-V4-201 | ENSMUST00000103554 | 426 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Mir1198-201 | ENSMUST00000116995 | 121 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm25543-201 | ENSMUST00000122678 | 312 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm22026-201 | ENSMUST00000122735 | 281 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Gm5269-201 | ENSMUST00000183590 | 138 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Hsf3-202 | ENSMUST00000119035 | 2691 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | AC124346.2-201 | ENSMUST00000217986 | 5083 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm24119-201 | ENSMUST00000103979 | 246 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | Gm37997-201 | ENSMUST00000193515 | 267 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
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| Foxd1 | Q61345 | AC123860.1-201 | ENSMUST00000228033 | 481 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm24966-201 | ENSMUST00000082443 | 79 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm24204-201 | ENSMUST00000082950 | 107 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm23850-201 | ENSMUST00000083830 | 169 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Zfp534-201 | ENSMUST00000117638 | 2885 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Vmn1r81-203 | ENSMUST00000227973 | 14002 nt | APPRIS P2 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | 4930533N22Rik-201 | ENSMUST00000206433 | 3509 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr298-204 | ENSMUST00000217110 | 3549 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr1457-204 | ENSMUST00000215229 | 2538 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Snord19-201 | ENSMUST00000104609 | 76 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm15669-201 | ENSMUST00000147834 | 526 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr1366-201 | ENSMUST00000168629 | 1054 nt | APPRIS ALT2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm23571-201 | ENSMUST00000180073 | 127 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Mrgprb1-203 | ENSMUST00000188918 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm34648-201 | ENSMUST00000202460 | 338 nt | TSL 2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr439-ps1-201 | ENSMUST00000204679 | 307 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm5002-201 | ENSMUST00000207145 | 223 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Olfr1366-204 | ENSMUST00000218154 | 1054 nt | APPRIS P2 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | AC131759.1-201 | ENSMUST00000220642 | 310 nt | TSL 3 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm10025-201 | ENSMUST00000079568 | 372 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm24164-201 | ENSMUST00000093663 | 104 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Gm4746-201 | ENSMUST00000120395 | 2406 nt | BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |
| Foxd1 | Q61345 | Vmn1r216-203 | ENSMUST00000228389 | 10213 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.77 | □□□□□ -1.81 | | |