Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sh3bp1P55194 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms