Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm22540-201ENSMUST00000158168 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Hoxd9P28357 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms