Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
Ccl20O89093 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
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