Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn4O35054 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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