Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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Gm21887J3QQ04 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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Gm21887J3QQ04 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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Gm21887J3QQ04 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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Gm21887J3QQ04 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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Gm21887J3QQ04 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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Gm21887J3QQ04 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Gm21887J3QQ04 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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Gm21887J3QQ04 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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Gm21887J3QQ04 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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Gm21887J3QQ04 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm21887J3QQ04 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm21887J3QQ04 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Gm21887J3QQ04 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm21887J3QQ04 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm21887J3QQ04 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm21887J3QQ04 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Gm21887J3QQ04 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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