Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm23812-201ENSMUST00000175156 84 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm23374-201ENSMUST00000175408 84 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Snord8-201ENSMUST00000175303 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ApobE9Q414 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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