Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ccdc171E9Q1U1 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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