Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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Pggt1bQ8BUY9 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Pggt1bQ8BUY9 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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