Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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