Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PtpreP49446 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PtpreP49446 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PtpreP49446 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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PtpreP49446 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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PtpreP49446 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PtpreP49446 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PtpreP49446 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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