Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm25678-201ENSMUST00000174984 73 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Trdv5-201ENSMUST00000103685 438 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Hoxd9P28357 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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