Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ggta1P23336 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms