Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Ccl20O89093 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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