Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm25141-201ENSMUST00000083177 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Cldn4O35054 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.1 ms