Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm22013-201ENSMUST00000158788 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm22595-201ENSMUST00000104250 130 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm29344-201ENSMUST00000068143 210 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ApobE9Q414 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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