Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cln8Q9QUK3 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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