Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RabggtaQ9JHK4 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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