Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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