Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Chmp3Q9CQ10 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Chmp3Q9CQ10 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms