Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Apobec3Q99J72 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms