Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Pggt1bQ8BUY9 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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