Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Dsg1bQ7TSF1 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Dsg1bQ7TSF1 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Dsg1bQ7TSF1 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Dsg1bQ7TSF1 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Dsg1bQ7TSF1 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Dsg1bQ7TSF1 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Dsg1bQ7TSF1 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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