Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
Ccdc18Q640L5 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Mir574-201ENSMUST00000103854 78 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
Ccdc18Q640L5 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Ccdc18Q640L5 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 342.2 ms