Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp1P55194 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp1P55194 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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