Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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Ccl20O89093 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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