Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn4O35054 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160 ms