Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Mir7043-201ENSMUST00000184219 70 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC154832.1-201ENSMUST00000228928 141 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Mir145b-201ENSMUST00000184434 75 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ApobE9Q414 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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