Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.2 ms