Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Gm6880A3KG45 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Gm6880A3KG45 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 384 ms