Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Ccdc47Q9D024 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Ccdc47Q9D024 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
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