Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Hoxa13Q62424 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Hoxa13Q62424 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms