Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Ssbp4Q3U4B1 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm24522-201ENSMUST00000083964 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Ssbp4Q3U4B1 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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