Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm25964-201ENSMUST00000157171 97 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm25465-201ENSMUST00000157716 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Snord45b-201ENSMUST00000082797 71 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Hoxd11P23813 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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