Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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Ggta1P23336 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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Ggta1P23336 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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Ggta1P23336 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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Ggta1P23336 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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Ggta1P23336 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ggta1P23336 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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Ggta1P23336 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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Ggta1P23336 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
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Ggta1P23336 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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Ggta1P23336 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ggta1P23336 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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