Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccl20O89093 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Ccl20O89093 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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