Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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Cited2O35740 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Cited2O35740 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Cited2O35740 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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