Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm23335-201ENSMUST00000117021 90 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 n-R5s8-201ENSMUST00000104121 118 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Mir3101-201ENSMUST00000175607 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm21830-201ENSMUST00000178898 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm25991-201ENSMUST00000102439 99 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ApobE9Q414 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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