Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Ccdc171E9Q1U1 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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