Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Sgo1Q9CXH7 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Sgo1Q9CXH7 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Sgo1Q9CXH7 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Sgo1Q9CXH7 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Sgo1Q9CXH7 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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