Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Mrpl49Q9CQ40 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Mrpl49Q9CQ40 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms