Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp4Q921I6 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.3 ms